Termički ciklus: Termički ciklus je jezgra komponenta PCR analizatora, koji se koristi za kontrolu cikličke reakcije reakcijskog enzima i ciljnog uzorka na različitim temperaturama. Toplinski ciklus može postići brzu promjenu temperature kroz Peltier elemente ili druge tehnologije i održavati određenu temperaturu u svakom ciklusu. Termički ciklus obično uključuje jedan ili više reakcijskih modula, od kojih svaki može neovisno kontrolirati temperaturu i vrijeme kako bi se postigla istovremeno otkrivanje više uzoraka.
Optički sustav: Optički sustav koristi se za otkrivanje i mjerenje fluorescentnog signala generiranog PCR reakcijom. Optički sustav može odrediti prisutnost i količinu cilja uzbudljivim fluorescentnim markerom (poput FAM, Hex ili ROX) i otkriti njegov intenzitet fluorescencije. Optički sustav obično uključuje jedan ili više izvora svjetla pobude, poput LED ili laserskih svjetala, i detektor fluorescencije, poput PMT (fotomultiplikarska cijev) ili CCD (Elektronski čip za snimanje).
Softverski sustav: Softverski sustav koristi se za kontrolu rada i analize podataka PCR analizatora. Općenito, softverski sustav PCR analizatora može postaviti reakcijske uvjete, nadzirati napredak reakcije, zabilježiti podatke reakcije i analizirati rezultate. Softverski sustav može se povezati s PCR analizatorom putem USB, serijskog porta ili mreže i pruža grafičko sučelje i alate za analizu podataka.
Sustav uzorkovanja: Sustav za uzorkovanje koristi se za opterećenje i miješanje PCR reakcijskog sustava. Obično, sustav za uzorkovanje može automatski učitati uzorke i druge spojeve, poput prajmera i enzima, te ih miješati i rasporediti prije nego što reakcija započne. Sustav za uzorkovanje može postići učitavanje uzorka i distribuciju kroz cijevi, šprice ili druga sredstva.
Sustav kruga: Sustav kruga koristi se za kontrolu i praćenje radnog statusa PCR analizatora, uključujući temperaturu, vrijeme, intenzitet fluorescencije i druge parametre. Sustav kruga može implementirati mikrokontroler, digitalni signalni procesor ili druge elektroničke komponente.
Mehanički sustav: Mehanički sustav koristi se za pomicanje, podešavanje i kontrolu mehaničkih dijelova PCR analizatora, poput toplinskog ciklusa, optičkog sustava i sustava uzorkovanja. Mehanički sustav može se implementirati prijenosnim sustavom, pogonskim sustavom i senzorskim sustavom.